Przesiewanie osoby bezobjawowej w przypadku ryzyka genetycznego AD 3

Pan Mathis powinien przejść sekwencjonowanie całego genomu, jeśli testowanie nie może rozpocząć się od chorego członka rodziny. Sekwencjonowanie całego genomu kosztuje prawie tyle samo, co niestandardowe sekwencjonowanie genów nowotworowych. Wybór zawiasów testowych, na których test może dać ostateczną odpowiedź na kliniczne pytanie.
Sekwencjonowanie całego genomu ma kilka ważnych zalet technicznych w porównaniu z sekwencjonowaniem panelu genu i sekwencjonowaniem egzomu, które wymagają albo reakcji łańcuchowej polimerazy, albo innej metody, takiej jak wychwytywanie, w celu wzbogacenia regionów kodujących genomu (egzomu) przed sekwencjonowaniem. Ryzyko zarówno sekwencjonowania genu-panelu, jak i sekwencjonowania egzonu polega na tym, że mogą one utracić warianty DNA lub nie przechwycić pewnych regionów egzomu, tym samym obniżając czułość i powodując zauważalne fałszywie ujemne wskaźniki zmian genetycznych w regionach kodujących geny nowotworowe. . Ponadto, żadna z tych metod nie może wykryć rearanżacji genomowych (które powodują, na przykład, tasowanie części kodujących genu, jak często widuje się w BRCA1) lub delecję całych eksonów (co występuje, na przykład, w przypadku gen wrażliwości nowotworu piersi CHEK26). Sekwencjonowanie całego genomu jest nie tylko mniej podatne na te słabości, ale zapewnia również sekwencję niekodującego DNA, w tym intronów. Istnieje pięć względnie częstych mutacji intronowych w BRCA1, które są pomijane przez sekwencjonowanie egzonów.
Kolejną korzyścią z sekwencjonowania całego genomu jest potencjał do wtórnych ustaleń – to jest klinicznie istotnych wariantów u osoby, która ma tylko znaczenie styczne dla danego pytania, ale wiedza o tym może okazać się krytyczna dla opieki tej osoby. Na przykład najnowsze wytyczne zalecają, aby przed rozpoczęciem terapii 5-fluorouracylem należy poddać badaniu przesiewowe pod kątem wariantów genów wpływających na odpowiedź na ten lek7; jeśli pacjent wymagający terapii 5-fluorouracylem był uprzednio poddany sekwencjonowaniu całego genomu, można było uniknąć testów, które mogłyby opóźnić rozpoczęcie terapii. Poza tak powszechnymi wariantami można również zidentyfikować rzadkie zagrożenia genetyczne, takie jak toksyczność winkrystyny powiązana z wariantami powodującymi chorobę Charcot-Marie-Tooth. Znajomość takich wariantów przed rozpoczęciem chemioterapii może pomóc w zapobieganiu toksycznym efektom terapii.
Sekwencjonowanie całego genomu zapewnia repozytorium zmienności w całym genomie, niezależnie od aktualnej wiedzy – lub jej braku – o tożsamości, funkcji i znaczeniu genu dla ryzyka choroby. Ponieważ zidentyfikowano nowe geny, które po zmutowaniu stwarzają ryzyko zachorowania na raka, nowe informacje o ryzyku mogą być dostarczane osobie.
Oprócz zalet sekwencjonowania całego genomu w identyfikowaniu predyspozycji do raka i informowania o wyborach terapeutycznych, sekwencjonowanie całego genomu może dostarczyć informacji na temat genetycznego ryzyka innych chorób, takich jak hemochromatoza lub zaburzenia metabolizmu lipidów. Takie wyniki mogą potencjalnie ulepszyć lub udoskonalić strategie zapobiegania ryzyku dla pacjenta. Ponieważ potencjalne korzyści wynikające z wielu programów badań przesiewowych są kontrowersyjne, 8 sprawozdanie z ustaleń wtórnych nie jest wymagane przez większość laboratoriów badawczych. W sytuacjach, w których lekarze lub pacjenci uważają potencjalne szkody za korzyści wynikające z raportu o odkryciach wtórnych, mogą zdecydować, że nie zostaną im zgłoszone te wyniki. W związku z tym ewentualna szkoda związana z odkryciami wtórnymi nie powinna być uważana za konieczną wadę sekwencjonowania całego genomu.
Podsumowując, jeśli dotknięty krewny nie jest dostępny, sekwencjonowanie całego genomu daje największą szansę na ustalenie, czy pan Mathis jest zagrożony dziedzicznym rakiem. Dzięki tym testom może on również zdecydować się na uzyskanie informacji o ryzyku związanym z leczeniem raka lub o innych genetycznych zagrożeniach dla zdrowia, które może on mieć.
Aby udostępnić swoje komentarze na temat dowolnej z opcji, użyj formularza na karcie 1.
Formularze ujawnień dostarczone przez autora są dostępne wraz z pełnym tekstem tego artykułu pod adresem.
Author Affiliations
Z Departamentu Pediatrii, Medical College of Wisconsin, Milwaukee.

Głosowanie
Materiał uzupełniający
[patrz też: stomatolog poznań, dermatolog, leczenie ]